Velké partnerství : Bůh, věda a hledání smyslu /
O lidské situaci : filosofická analýza současného porozumění /
Hypotéza zjednotenia : výber z tvorby /
Glosy - Fragmenty /
Inteligentý dizajn bez Boha : hypotéza evolúcie riadenej inteligenciou & Teória zjednotenia /
Filozofické cesty z neistoty - podoby zodpovednosti /
Příroda a duše /
Boh a Stephen Hawking : kto to teda naplánoval? /
Chapters on the contemporary philosophy of science /
The magic of reality : how we know what´s really true /
Mysli! : proč by ses měl na všechno ptát /
Rozplétání duhy : věda, bludy a touha po zázraku /
Filozofia a kognitívne vedy /
Rozprava o vedách a umeniach, alebo, Odpoveď na otázku Dijonskej akadémie, či obroda vied a umení prispela k očiste morálky /
Úvod do filozofie nenásilného rozvoja /
Otázka človeka ako filozofický problém /
Fenomenologie ducha /
Patočka o vzniku matematickej prírodovedy /
Co je realita? : úvahy nad dílem Stéphana Lupasca /
O teologii v Teologické sumě : STh I, q. 1 /
O Boží moci. II /
Bůh ve filosofii Charlese Hartshorna /
Teodicea /
Theodicea přirozenosti : Lessing, Reimarus, Goeze /
Nietzscheho výrok "Bůh je mrtev" /
O Boží moci /
O Trojici v Teologické sumě : STh I, q. 27-43 /
Hledání Boží tváře /
Bůh a příroda : filosofické úvahy o náboženství a vědě 1979-1983 /
Meditationes de prima philosophia = Meditace o první filosofii /
Evoluce jako cesta k Bohu v díle Teilharda de Chardin /
Průkopníci a jejich odpůrci : světová katolická teologie 1871-1910 a evoluční vznik-stvoření člověka /
Hledání společného světa : úvahy o filosofii a proměnách vědění /
Listy o biologii : korespondence 1975-1990 a další texty /
Útržky ze zápisníku zemřelého přírodovědce /
Moudrost starých Čechů : komentovaná edice s navazující exilovou polemikou /
Dějiny biologických teorií novověku. Díl I., Od renesance na práh 19. století /
Šest kapitol o disentu /
Pojetí a prosazování komunistické výchovy v Československu 1948-1989 /
Cesty komunistickou diktaturou : kritické studie a eseje /