Tajomstvá 2000-ročnej kroniky : jedinečná nepretržitá kronika zvláštneho spoločenstva ľudí od dôb Ježiša Krista po súčasnosť = Sekreti 2000-ričnoji chroniky /
Rozchod s bohem : rádce pro začátečníky /
Boží blud : přináší náboženství útěchu, nebo bolest? /
Boh nie je mŕtvy : dôkazy Božej existencie vo veku neistoty /
Nová apologetika : obhajoba viery v postkresťanskej dobe /
Apologetika : učebnica náboženstva pre najvyšší ročník meštianských škôl /
Boh a Stephen Hawking : kto to teda naplánoval? /
Existiert Gott? : Antwort auf die Gottesfrage der Neuzeit /
Az ateizmus hét formája : és más esszék /
Bůh a člověk hledající smysl /
Dawkins pod mikroskopem : diskuse nad knihou Richarda Dawkinse Boží blud /
Prečo verím : zamyslenia na každý deň /
Bůh a jeho lidské dějiny /
Príbeh hľadania (viery v) Boha /
Medzi rozprávkou a vedou /
Mýtus evoluce : co je základem našeho života: evoluce, nebo stvoření? /
Discours de métaphysique = Metafyzická rozprava : francouzsko-české vydání /
Odhalenie tajomstva Božskej kozmickej hry, alebo, Tajomstva absolútno-relativity /
Sekularizácia a sekularizmus /
Život bez strachu : nech sa deje čokoľvek, žite odvážne /
Souboj světových názorů : setkání moderní vědy se spiritualitou /
Islám : hluboké nahlédnutí /
Celostný obraz sveta : hľadanie pravdy o sebe, živote a vesmíre /
Teilhard de Chardin, prorok Krista vždy většího : primát Krista a transcendence člověka /
Od evoluční teorie k nové teorii stvoření : omyly darwinismu a protinávrh /
Mosty k porozumění : rozhovory předních vědců s dalajlamou o zkoumání lidské mysli /
Vesmír v jediném atomu : sbližování vědy a spirituality /
Fyzika viery /
Sila, ktorá zmení svet /
Jak katolická církev budovala západní civilizaci /
Racionalita versus transcendence : spor Hanse Alberta s moderními teology /
Zápolení o naději a lidskou důstojnost : česká katolická teologie 1850–1950 a výzvy přírodních věd v širším světovém kontextu /
Bible a moderní kritika : česká a světová progresivní exegeze ve víru (anti-)modernistické krize /
Rozhodné pojednání o vztahu náboženství a filosofie /
Galileo Galilei /
Hádání v hospodě : jak se v hospodě U Jirásků na Královských Vinohradech hádal jeden samorostlý myslitel s jedním vědcem a jak se do jejich hádky později vmísili i jiní lidé /
Život pochází ze života : [výzva moderní vědě] /
De mundi aeternitate ; De summo bono /
Svoboda k pravdě /
Žít s tajemstvím : podněty k promýšlení víry /
The god delusion /
Náboženství pro ateisty : bezvěrcův průvodce po užitečných stránkách náboženství /
Vzdáleným nablízku : vášeň a trpělivost v setkání víry s nevírou /
Tomáš Halík : smířená různost : rozhovor /
Vzestup a pád moderního ateismu /
Divadlo pro anděly : život jako náboženský experiment /
Atheismus im Christentum : zur Religion des Exodus und des Reichs /
Traktát o třech podvodnících : příběh kacířské knihy, která neexistovala /
O vědě a náboženství /
O náboženství /
Náboženství bez Boha /
Stromu zbývá naděje : krize jako šance /
Bůh a stát : Knutogermánská říše a sociální revoluce. II /
Záblesk v temnotě : jak jsem žil s vědou : paměti II /
The reason for god : belief in an age of skepticism /
Diabolský blud : ateizmus a vedecké domýšľavosti /